gbif-collection-effortlisted

# Effort de collecte (GBIF) ## Pourquoi c'est la variable la plus importante Dans toute analyse de couverture — chimique, génomique, fonctionnelle — la probabilité qu'une espèce ait été étudiée dépend d'abord du nombre de fois où des humains l'ont rencontrée. Si vous ne contrôlez pas cet effort, vous mesurez l'histoire des herbiers et vous croyez mesurer la biologie. Corrélation mesurée sur 3 042 espèces : **0,495** entre effort de collecte et présence d'une chimie décrite, contre **0,220** pour l'aire native. L'effort domine. ## Comment le mesurer **Effort mondial d'une espèce** : nombre total d'occurrences GBIF, tous pays confondus. ``` GET https://api.gbif.org/v1/species/match?name={nom}&kingdom=Plantae -> usageKey GET https://api.gbif.org/v1/occurrence/search?speciesKey={key}&limit=0 -> count ``` **Inventaire d'un territoire** : facette sur `speciesKey`. ``` GET https://api.gbif.org/v1/occurrence/search ?country=MQ&taxonKey=7707728&limit=0&facet=speciesKey&facetLimit=5000 ``` `taxonKey=7707728` = Tracheophyta (plantes vasculaires). Pour de gros volumes, préférer les téléchargements SQL de GBIF (compte gratuit requis, un DOI est généré et doit être cité). ## Trois pièges à connaître **Le nombre de pays n'est pas une aire de répartition.** Il additionne aire native, naturalisation, horticulture et erreurs de géoréférencement, et subit le découpage politique — un endémique du Brésil marque 1 comme un endémique d'une petite île. Corrélation avec l'effort :