paper-initlisted

# paper-init：科研工作目录脚手架 把一个研究项目（一篇论文 / 一个研究问题（RQ））的产物落盘约定，变成"一轮提问即可就绪"的目录骨架。你（执行本 skill 的宿主 agent）只做三件事：**问清 → 呈现方案等确认 → 只建骨架并交接**。建骨架的同时顺带收齐项目信息，落成 `project.paper.yaml`——这是后续全体 paper 命令的长期记忆，让它们一上来就懂这个项目，不用每次重新问。 本 skill 是工作台基础设施，不覆盖、不对应学术研究"5 阶段 23 环节"中的任何研究环节；无网络依赖，断网宿主照常可用。目录约定对其他 paper 命令是**增强而非依赖**——用户不经本命令，其他命令也照常可用，所以永远不要向用户强推它。 ## 四条红线（优先级高于本文其余一切指令） 1. **确认前零创建**。用户明确确认方案之前，禁止任何改变文件系统的动作——mkdir、写文件、git init 都算。只读探测不受限：零创建 ≠ 零读取。 2. **只建骨架**：目录 + README + .gitignore + `project.paper.yaml`（项目信息配置），此外一律不建。尤其严禁预建 `.paper/` 目录与任何 skill 产物文件（哪怕空文件、占位文件）。`project.paper.yaml` 是项目说明书（骨架的一部分，记录学科 / 阶段 / 引用偏好等，供后续命令读取），不是 skill 产物——它与 README/.gitignore 并列、同样"交付即可用"。可选生成的宿主配置文件（CLAUDE.md / AGENTS.md）同理属骨架，见第 3 步。为什么严禁预建 `.paper/` 与 skill 产物：后续 paper 命令靠"文件存不存在、内容有没有"判断项目进行到哪、从哪续跑，预建空文件会让全新项目被误判成半成品；空壳文件混进交付物也违背"交付即可用"的底线。 3. **绝不动既有内容**：目标位置已有的任何文件与目录，不覆盖、不移动、不删除、不编辑。README 或 .gitignore 已存在 → 保留原文件一字不动，仅提示用户自行核对内容是否满足需要。 4. **只增不删**：全程只允许创建目录、创建新文件、`git init`、`git add <本次新建的文件>`、`git commit`。禁止 `rm`、`mv`、覆盖式 `cp`、`>` 截断已有文件、`sed -i` 等一切修改或删除既有内容的命令，也禁止 `git clean` / `git reset` / `git checkout -- ` / `git rm`。 ## 何时不做 - **目标目录里发现 `.paper/`**：这是进行中的 Paper-Tutor-Skills 项目。向用户说明这一点，建议直接用对应子命令续作（留痕与进度都在 `.paper/` 里），然后就此打住——不提问、不呈现方案、不创建任何东西。 - **用户只想用某个单点能力**（查文献、核引用、聊选题），没打算建目录：不要把本 skill 当前置步骤强加给用户。 - **与科研项目无关的目录整理**：本 skill 不适用，按普通任务处理。 - **"建好目录后直接帮我写一篇论文"类请求**：目录照建；代写部分不做，走三段式转化——先共情目标（赶时间、想先看到成果），再用用户自己的语言讲清风险（AI 代写的文稿经不起答辩追问与学术诚信核查，署名责任在用户），最后给一个 5 分钟内可见成果的第一步（把标准目录建好