paper-select-journal

# Paper Select Journal ## 核心原则 - 当前信息必须实时核验：scope、官网、业内认可度、中科院分区、近 3 个月论文都属于时效性信息，不能靠旧记忆。 - 中间文件只允许落在当前工作目录下的 `.paper-select-journal/` 隐藏目录；用户若明确指定其他目录，才可覆盖默认值。 - Set1 不再依赖固定语义权重。脚本只负责最小硬过滤与候选池整理，真正的语义规划由当前宿主模型完成。 - Set1 不是最终答案。最终报告只保留证据充分的 Set3，最多 10 个期刊。 - 不能推荐明显预警、垃圾期刊或影响因子低于 `3` 的期刊；若确实保留低于 `3` 的例外，必须写明“为何它仍是领域内人类专家认可的稳妥选择”。 - 宁可少报，也不要为了凑满 10 个而硬凑。 ## 输入与工作区 - 用户需求可选，manuscript 必选。 - manuscript 可来自粘贴的标题 / 摘要 / 全文片段，或本地 `.md`、`.txt`、`.tex`、`.pdf`、`.docx`，也可混合提供。 - 一旦进入隐藏工作区流程，后续供脚本读取的 `analysis/*.json` 必须保留在当前 run 目录内；不要把 `manuscript_profile.json`、`set2_scope_review.json`、`final_recommendations.json` 指到 run 目录外。 先初始化隐藏工作区： ```bash python3 <skill_root>/scripts/init_workspace.py --project-root . ``` 脚本会创建 `.paper-select-journal/run-<timestamp>/`，其中至少包含： - `inputs/` - `analysis/` - `candidates/` - `pubmed/` - `reports/` 后续所有中间文件都必须留在该 run 目录内。 ## 工作流 ### 1. 先写 manuscript 画像 完整理解论文后，把结果写入 `analysis/manuscript_profile.json`。 - 模板：`templates/manuscript_profile.template.json` - 写法：`references/manuscript-profile.md` 最低字段： - `title` - `abstract` - `keywords` - `manuscript_summary` 画像的作用是帮助 AI 理解稿件，而不是喂给固定打分公式。 如果用户偏好复杂，优先把偏好写成自然语言放进 `target_journal_brief` 或 `notes`，不要为了脚本凑很多硬编码线索。 如果确实需要保留低 IF 的人工例外期刊，只能作为后续人工补录候选，并且必须在最终报告里解释“为什么它虽然低于阈值，仍是领域内稳妥选择”。 ### 2. 用内置 `2023IF.xlsx` 做 Set1 候选池 内置目录：`assets/journal_catalog/2023IF.xlsx` 运行： ```bash python3 <skill_root>/scripts/shortlist_journals.py \ --workspace .paper-select-journal/run-<timestamp> \ --profile .paper-se...